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allgemeines Die Kopie der DNA auf die RNA ist ein komplexer, vielfältig geregelter Vorgang.
RNA - Polymerase Kopierenzym. RNAPII: RNA Polymerase II Erfordert den Coaktivator - Komplex Mediator.
Mediator Mediator verbindet transkriptionale Regulatoren und RNAP II(1). Besteht aus 25 Subunits, dir Kopf, Mittelstück, Schwanz und Kinase - Module 5, 6, 7 Der Kopf besteht aus dem essentialen Mediator - Core8 Core8 besteht aus den Subunits Med6, Med8, Med11, Med17, Med18, Med20 and Med22.
Repressor Mechanismus zum "Abschalten" eines Gens. Z. B. blockiert der Lac-Repressor die Initiationsstelle der DNA eine Coli - Bakteriums, wenn kein Bedarf für ein laktosespaltendes Enzym besteht. Bei hoher Laktosekonzentration bindet sich Laktose an den Lac-Repressor. Der Lac - Repressor zerfällt und das Gen wird eingeschaltet.
Das ringförmige Protein TRAP des Bacillus subtilis reguliert ein Tryptophansyntheseprotein. TRAP bindet sich an die neu syntheisierte mRNA und bildet eine haarnadelartige RNA-Schleife. Dieser Komplex blockiert die Polymerase und verhindert die Transskription. Das gleiche Protein kann ein Transporter - Gen ausschalten indem des auf der mRNA die Stelle blocliert, an der die Ribosomen die Translation starten.
Histone Basische Proteine des Zellkerns. Stabilisiert die DNA durch Bildung von Nukleosomen. Histongebundene DNA ist kondensiert (Heterochromatin) und transscribiert nicht. HDAC
Methylierung Anhängen von Methylgruppen an die DNA. Entscheidet darüber ob Gene abgelesen werden oder nicht.
AGO1/2 Argonaute-1/2. Ein Protein, welches beim RNA-mediierten Gene - Silencing (RNAi) benötigt wird. Bindet an kurze RNAs wie microRNAs (miRNAs) oder kurze interferierende RNAs (siRNAs) und reprimiert die Translation von mRNAs, die komplementär zu ihnen sind. Hat keine Endonuclease - Aktivität und schneidet keine Ziel - mRNAs. Wird auch für das transcriptionelle Gene - Silencing (TGS) von Promotorregionen benötigt, die komplementär kleine antigene RNAs (agRNAs) binden.
Transkriptom Summe aller Transkriptionsfaktoren einer Zelle. Dazu gehören epigenetische (Methylierung), transkriptionale (Transkriptionsfaktoren), and post-transkriptionale Mechanismen.
spezielle Transscriptionsfaktoren NF-κB C-MYC Rfx6, Grhl2 MYOD1,AP-2
Fox SATB1, MiT HOX Zink - Finger
Quellen 1.) Cramer P, et al.:
Structure of the Mediator head module.
Nature 2012, doi: 10.1038/nature11670

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